A la suite des chantiers de fouilles effectuées par François Eygun, directeur des Antiquités Historiques, autour de l’église et de la nécropole de Civaux en 1960-64, un dépôt de fouilles, dénommé "musée", a été construit face à la nécropole. Dans les années 1980, l’objectif de créer un musée archéologique s’est précisé au niveau du Conseil municipal sous l’impulsion de l’Association des Amis du Pays de Civaux.
Le choix de l’implantation du musée a été arrêté en 1999 lors de l’achat par la commune du bâtiment face à l’entrée de l’église, bâtiment qui avait servi à l’enseignement scolaire à la fin du siècle dernier et lors de la guerre de 1939-1945. Les travaux importants de restructuration et d’agrandissement ont été financés par la commune et la mise en place d’un parcours muséographique a été élaborée par un comité de pilotage à partir de 2000.
Le comité de pilotage comprenait Jean-Claude Papinot, inspecteur général honoraire de l’archéologie, Jean-Pierre Pautreau, directeur de recherches au C.N.R.S., Jean-François Baratin, conservateur régional de l’archéologie, Mesdames Jaspart, Koch, Nadeau, Péricard et Schoumacher et Messieurs Grignon, Le Floc’h et Schrével de l’Association des Amis du Pays de Civaux et Hélène Crouzat, responsable du musée. Xavier Sanchez, architecte D.P.L.G. (Paris) a effectué la maîtrise d’œuvre et la réalisation du parcours muséographique assisté d’Expo-Média Conseil, Isabelle Morin et de Bulnes et Robaglia, graphistes.
Catherine Augel, conservatrice-restauratrice à Saint-Savin, a assuré la restauration de l’ensemble des objets exposés dans les salles.
Le musée archéologique a ouvert ses portes le 7 mars 2004.
Le musée en quelques dates :
- 2000-2001 : rénovation du bâti ancien et construction de l'extension moderne
- décembre 2002 : début des travaux muséographiques
- 2003 :
- adhésion à Via Romana, aujourd'hui Via Antiqua
- installation des sarcophages dans la cour
- mis en place des objets dans les vitrines
- pose des panneaux
- 7 mars 2004 : ouverture du Musée archéologique alors appelé "Centre culturel"
- 2005 : 1° participation à la Nuit européenne des Musées
- 2010 :
- adhésion à Alienor.org, le réseau des musées de Poitou-Charentes
- 1° participation à la Fête de la Science
- 2011 :
- création de la maquette de l'église
- partenariat avec l'abbaye de Saint-Savin, les musées de préhistoire de Lussac-les-Châteaux et du Grand-Pressigny et le Roc-aux-Sorciers
- 2012 :
- 1° Nuit romane à Civaux
- 1° participation aux Journées nationales de l'archéologie
- 2013 :
- adhésion à l'association européenne "A l'aube de l'Europe, Francs et Wisigoths"
- obtention du label Tourisme et Handicap
- 2014-2015 : nouvelle phase de travaux
- transformation du préau en salle
- ajout de deux nouvelles vitrines en salle 2 et 3
- restauration d'objets
- mise en place d’un panneau chronologie
- remplacement du grand panneau dans la cour
- réalisation d'une maquette de l'église
- 2015 :
- le musée devient un musée municipal
- mise en place des audioguides
- 2016 : création du jardin romain
- 2017 :
- lancement du site Internet du musée
- audioguides disponibles en anglais
- 2018 : audioguides disponibles en espagnol
- 2019 :
- mise en place d'une buvette avec salon de jardin
- création du jardin mérovingien
- 2021 :
- chasse au trésor les Six veaux d'or : coup de coeur des Expériences famille de la Vienne
- 2022 :
- sur la maquette, ajout de la partie sanctuaire/baptistère
- nouveaux aménagements muséographiques en salle 2
- 2023 :
- chasse au trésor les Six veaux d'or : coup de coeur des Familles - Expériences famille de la Vienne
- 2024 :
- nouveaux aménagements muséographiques
- nouveau film consacré au patrimoine et à l'archéologie de Civaux